What are the three types of microbiome?

El Vínculo Intestino-Cerebro y Tu Microbioma

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La conexión entre el intestino y el cerebro, a menudo referida como el eje intestino-cerebro, es un campo de estudio que ha ganado una atención considerable en los últimos años. Lejos de ser sistemas aislados, nuestro tracto gastrointestinal y nuestro cerebro están en constante comunicación bidireccional, influenciándose mutuamente de maneras profundas y a veces sorprendentes. Esta intrincada relación puede tener un impacto significativo en nuestra salud general, desde la digestión hasta nuestro estado de ánimo y comportamiento.

What is the connection between microbiome and brain?
The microbiome affects your gut, which affects your brain. The brain affects your gut, which affects your microbiome.” Disruptions to the gut microbiome, say by infection or a change in diet, can trigger reactions in the body that may affect psychological, behavioral, and neurological health.Sep 21, 2021

Para muchas personas, esta conexión es más que una teoría científica; es una realidad vivida. Consideremos la experiencia de Calliope Holingue, cuya obsesión por el vínculo intestino-cerebro nació de su propia lucha con un trastorno obsesivo compulsivo (TOC) desde la infancia y problemas gastrointestinales cada vez más incapacitantes que comenzaron en la adolescencia. Sus síntomas digestivos, incluyendo dolor intenso y reacciones severas a los alimentos, a menudo ocurrían incluso cuando no se sentía estresada o ansiosa, desafiando la explicación médica convencional que los atribuía únicamente a factores psicológicos. Esta desconexión entre las explicaciones médicas y su experiencia personal la impulsó a buscar soluciones por sí misma, explorando dietas, probióticos y mindfulness mucho antes de que la palabra “microbioma” se volviera común. Su viaje personal hacia la mejora de su salud física y emocional, aunque continuo, la llevó a canalizar este conocimiento en su trabajo de posgrado e investigación, centrándose ahora en este crucial vínculo en el contexto del autismo.

Índice de Contenido

La Sorprendente Conexión Intestino-Cerebro

El intestino, a menudo llamado nuestro 'segundo cerebro', alberga miles de millones de microorganismos, colectivamente conocidos como el microbioma intestinal. Esta vasta comunidad microbiana no es solo un pasajero pasivo; desempeña roles activos en la digestión, la síntesis de vitaminas y la protección contra patógenos. Pero su influencia se extiende mucho más allá del tracto digestivo.

La comunicación entre el intestino y el cerebro se realiza a través de diversas vías. El nervio vago, una autopista neural directa, permite una rápida comunicación bidireccional. Además, las células inmunes en el intestino pueden enviar señales al cerebro, y los propios microbios producen una variedad de compuestos, incluyendo neurotransmisores (como la serotonina) y ácidos grasos de cadena corta (SCFAs), que pueden afectar la función cerebral. Los SCFAs, como el butirato, son producidos cuando las bacterias intestinales fermentan la fibra dietética y son una fuente de energía para las células del colon, además de tener efectos antiinflamatorios y potencialmente neuroprotectores.

La experiencia de Calliope Holingue subraya un punto crucial: los problemas en el intestino pueden manifestarse o exacerbar condiciones de salud mental, y viceversa. La ansiedad y el estrés pueden afectar la motilidad intestinal y la composición del microbioma, mientras que una disbiosis (un desequilibrio en el microbioma) o la inflamación intestinal pueden influir en el estado de ánimo y el comportamiento. Esta interconexión destaca la importancia de considerar la salud intestinal al abordar la salud mental y viceversa.

Desvelando el Microbioma: ¿Qué Son los Enterotipos?

Dada la inmensa complejidad del microbioma intestinal, con sus miles de especies bacterianas, los científicos buscan formas de simplificar y entender mejor esta comunidad. Al igual que los urbanistas categorizan una ciudad en zonas residenciales, comerciales o industriales para comprender su dinámica, los científicos idearon un método para clasificar el microbioma humano maduro en categorías, a las que se refieren a menudo como enterotipos o tipos de intestino.

El concepto de enterotipos fue introducido por primera vez en 2011. La idea inicial proponía clasificar el microbioma intestinal humano maduro en tres tipos distintos, basados en las especies bacterianas dominantes: Bacteroides, Prevotella y Ruminococcus. Esta clasificación inicial proporcionó un marco para empezar a agrupar y estudiar las diferentes composiciones microbianas que se encuentran en las poblaciones humanas.

Es importante destacar que estos tipos de intestino adulto son diferentes de los tipos de intestino que se observan en bebés (de 0 a 12 meses), ya que el microbioma de los bebés es considerablemente menos diverso que el de los adultos y está en una etapa de desarrollo temprano.

Los Diferentes Tipos de Microbioma Intestinal

Aunque la clasificación inicial propuso tres enterotipos, la investigación continua y el análisis de conjuntos de datos más grandes han llevado a la identificación de un número variable de tipos. Algunas metodologías aún se centran en dos o tres tipos principales, mientras que otras, como la utilizada por Tiny Health mencionada en la información proporcionada, han identificado hasta siete tipos distintos en el microbioma maduro. Estos siete tipos son:

  • Bacteroides
  • Prevotella
  • Ruminococcaceae
  • Lachnospiraceae
  • Bifidobacterium
  • 'Other' (Otro)
  • Enterobacteriaceae

Exploremos las características principales asociadas a cada uno de estos tipos, basándonos en la información proporcionada:

El Tipo de Intestino Bacteroides

Este tipo es muy común, especialmente en países desarrollados. Está dominado por especies de los géneros Bacteroides, Phocaeicola o Parabacteroides. Se observa frecuentemente en personas cuyas dietas son ricas en alimentos de origen animal (proteínas y grasas) y tienen un menor consumo de alimentos de origen vegetal.

Dentro de los usuarios de Tiny Health, este tipo representa un porcentaje significativo (29% de adultos, 21% de niños y toddlers). Una ventaja de este tipo, en comparación con el tipo Prevotella, es que tiende a tener niveles más altos de especies de Bifidobacterium. Los bebés con un microbioma dominado por Bifidobacterium a menudo transitan a un tipo Bacteroides durante la niñez temprana. Además, se dice que este tipo tiene el mayor potencial para producir vitamina B12 y biotina.

La respuesta de los tipos de intestino a las intervenciones dietéticas puede variar. Para el tipo Bacteroides, aunque la fibra sigue siendo beneficiosa en general, las dietas ricas en fibra podrían no ser tan efectivas para la pérdida de peso como en otros tipos.

Se han identificado dos subtipos dentro del tipo Bacteroides: Bact1 y Bact2. El subtipo Bact2 se caracteriza por una baja diversidad, especies dominantes como Bacteroides fragilis, Phocaeicola vulgatus y Parabacteroides distasonis, y niveles muy bajos de Faecalibacterium prausnitzii. Este subtipo se asocia más a menudo con condiciones como obesidad, resistencia a la insulina y enfermedades inflamatorias como la enfermedad inflamatoria intestinal y la esclerosis múltiple.

El Tipo de Intestino Prevotella

Este tipo es menos común en países desarrollados. Suele estar dominado por Prevotella copri. Se asocia a menudo con dietas ricas en fibra vegetal, típicas de poblaciones con dietas no occidentales.

Representa un pequeño porcentaje de usuarios de Tiny Health (aproximadamente 2-3%). Una característica importante de P. copri es la variabilidad entre cepas en su capacidad para digerir fibras, lo que podría explicar las asociaciones de salud a veces contradictorias para este tipo.

Las asociaciones positivas incluyen: producción de SCFAs beneficiosos, mejora del metabolismo de la glucosa, efecto antiinflamatorio, pérdida de peso efectiva o mantenimiento con dietas altas en fibra (especialmente de cereales integrales) y colesterol más bajo.

Por otro lado, algunos estudios han asociado P. copri con condiciones inflamatorias, resistencia a la insulina e intolerancia a la glucosa. A pesar de estas contradicciones, el tipo Prevotella se ve a menudo en personas con dietas ricas en alimentos de origen vegetal. Tiene un alto potencial para digerir celulosa.

El Tipo de Intestino Ruminococcaceae

Este tipo es poco común, especialmente en países occidentales, lo que significa que hay menos estudios sobre su respuesta a intervenciones dietéticas o suplementos. Está dominado por especies de los géneros Ruminococcus, Ruminiclostridium y Faecalibacterium.

Representa menos del 0.5% de los usuarios de Tiny Health. Las bacterias dominantes son buenas fermentadoras de fibra de carbohidratos para producir SCFAs beneficiosos. Algunas especies también convierten el acetato, producido por otras bacterias, en butirato.

Debido a su capacidad para descomponer carbohidratos, se sugiere que este tipo podría facilitar el aumento de peso con una ingesta alta de carbohidratos, debido a una mayor disponibilidad y absorción de nutrientes.

El Tipo de Intestino Lachnospiraceae

Este es un tipo común en países occidentales y el más frecuente entre los usuarios de Tiny Health (35% de adultos, 50% de niños y toddlers). Está dominado por especies de los géneros Anaerostipes, Blautia y Roseburia.

Estas bacterias son eficientes en la digestión de fibras vegetales como el almidón, la inulina y la pectina, produciendo también SCFAs beneficiosos como el butirato. Sin embargo, la capacidad de digerir fibra y producir SCFAs varía según la especie dentro de este grupo.

What is the gut microbiota in neuroscience?
Gut microbiota-derived metabolites in neurodegenerative diseases. The gut microbiota contributes to host physiology and brain health by generating a variety of metabolites through bacterial de novo metabolism and by modifying host-derived molecules.

El Tipo de Intestino Bifidobacterium

Común en bebés, se considera una comunidad intestinal inmadura en niños y adultos. Aunque raro en adultos, se ve en muchos toddlers y algunos niños. Está dominado por especies beneficiosas de Bifidobacterium.

En usuarios de Tiny Health, se observa en 0.3% de adultos, 1.5% de niños y 16.5% de toddlers. Comparado con los tipos Bacteroides y Prevotella, tiene menor diversidad. En niños y toddlers, se considera menos maduro y podría tener dificultades para digerir carbohidratos complejos típicos de una dieta adulta. En adultos, la baja diversidad y el dominio de Bifidobacterium no son ideales, aunque estas bacterias son beneficiosas.

Este tipo es mejor que otros en la producción de aminoácidos de cadena ramificada, esenciales para la síntesis de proteínas musculares. Si un adulto presenta este tipo, se recomienda intentar diversificar el microbioma.

El Tipo de Intestino 'Other' (Otro)

Este tipo no está dominado por un grupo particular de bacterias, lo que lo hace muy diverso. Representa un 32% de adultos, 21% de niños y 8% de toddlers en Tiny Health.

No se considera negativo; de hecho, su alta diversidad puede ser beneficiosa para la salud intestinal. A medida que la investigación avanza, se espera obtener más información específica sobre este tipo.

El Tipo de Intestino Enterobacteriaceae

Este es un tipo raro, identificado en algunos estudios en poblaciones asiáticas, caracterizado por altos niveles de bacterias consideradas menos amigables, como Escherichia, Klebsiella, Salmonella, Citrobacter, Enterobacter y Raoultella.

Es poco común en toddlers y adultos en general. Se ha asociado con un mayor consumo de carne roja y tiempos de tránsito intestinal más rápidos en un estudio. También puede ser temporal, resultado de una infección intestinal reciente o tratamiento con antibióticos (ya que algunas de estas bacterias son resistentes a antibióticos). En estos casos, podría ser posible que la composición cambie tras la recuperación, quizás con ayuda de probióticos.

Se observa en 1% de adultos y 0.5% de niños y toddlers en Tiny Health. Se necesitan más estudios para entender su prevalencia global y sus desencadenantes.

Tabla Comparativa de Tipos de Intestino Comunes

Para visualizar mejor las diferencias entre algunos de los tipos de intestino más discutidos:

CaracterísticaTipo BacteroidesTipo PrevotellaTipo RuminococcaceaeTipo Lachnospiraceae
DominanciaBacteroides, Phocaeicola, ParabacteroidesPrevotella copriRuminococcus, Ruminiclostridium, FaecalibacteriumAnaerostipes, Blautia, Roseburia
Prevalencia (Países Desarrollados)Muy ComúnPoco ComúnPoco ComúnComún (Más común en usuarios TH)
Dieta AsociadaAlta en proteína/grasa animal, baja en vegetalAlta en fibra vegetalAlta en carbohidratos (potencial)Alta en almidón, inulina, pectina
Producción de SCFAsBuenaBuena (especialmente de fibra vegetal)Muy Buena (de carbohidratos)Buena (de fibras específicas)
Otras Características ClavePotencial B12/Biotina. Subtipo Bact2 asociado a inflamación/obesidad.Potencial digestión celulosa. Asociaciones contradictorias (inflamación vs. antiinflamatorio).Convertidores de acetato a butirato. Potencial para aumento de peso con carbohidratos.Fermentadores de fibras específicas.

Controversias y Matices de la Clasificación por Tipos

A pesar de la utilidad de los enterotipos para simplificar la complejidad del microbioma, este sistema de clasificación no está exento de controversias en la comunidad científica. Una de las principales fuentes de debate es el número exacto de tipos de intestino que existen. Dependiendo de la metodología analítica y los conjuntos de datos utilizados, los estudios han descrito consistentemente los tipos Bacteroides y Prevotella, pero el número total de tipos puede variar (dos, tres, o más, como los siete identificados por Tiny Health). Esto sugiere que la división en categorías discretas puede ser una simplificación excesiva.

Otra controversia importante es que los tipos de intestino no son tan definidos como, por ejemplo, los grupos sanguíneos (A, B, AB, O). Si bien algunas muestras de microbioma se ajustan claramente a un tipo dominante, muchas otras se encuentran en un espectro, mostrando características intermedias o superpuestas entre diferentes tipos. Es más preciso ver los tipos de intestino como puntos en un gradiente continuo de composiciones microbianas, en lugar de categorías estancas.

Finalmente, aunque los tipos de intestino pueden estar correlacionados con el riesgo de ciertas enfermedades, la respuesta a suplementos o dietas específicas, existe una considerable variabilidad *dentro* de cada tipo. Esto se debe a que diferentes especies e incluso diferentes cepas dentro de la misma especie bacteriana pueden tener funciones y efectos en la salud muy distintos. Por ejemplo, como se mencionó para el tipo Prevotella, diferentes cepas de P. copri pueden estar asociadas con efectos positivos o negativos, lo que complica la predicción de resultados basándose únicamente en la clasificación del tipo.

Más Allá del Tipo: Una Visión Integral

Dada la naturaleza compleja y a veces ambigua de la clasificación por tipos, para una comprensión más precisa de la salud de tu microbioma, es recomendable ir más allá de la simple identificación del tipo dominante. Analizar métricas específicas, como los niveles de especies bacterianas clave (tanto beneficiosas como potencialmente problemáticas) y evaluar el potencial funcional de la comunidad microbiana en su conjunto (como la capacidad de producir SCFAs o digerir fibra), puede ofrecer una imagen más detallada y útil.

Saber tu tipo de intestino puede, sin embargo, proporcionar algunas ideas generales sobre tu comunidad microbiana y dar pistas sobre posibles ajustes dietéticos que podrían ser beneficiosos. También puede ser interesante para comparar con miembros de la familia. Pero es crucial recordar que la ciencia detrás de los tipos de intestino aún está evolucionando, y no todas las características asociadas a un tipo particular se aplicarán necesariamente a cada individuo con ese tipo.

Preguntas Frecuentes (FAQ)

¿Es mi tipo de intestino fijo o puede cambiar?
Si bien la composición del microbioma adulto tiende a ser más estable que la de los bebés, puede cambiar en respuesta a la dieta, los antibióticos, enfermedades y otros factores. Aunque la clasificación en un 'tipo' puede ser una instantánea, la composición subyacente puede modificarse.

¿Hay un tipo de intestino 'mejor' que otro?
No hay un tipo de intestino único que sea universalmente 'mejor'. Cada tipo tiene asociaciones potenciales, tanto positivas como negativas, y lo que es saludable puede depender del contexto individual, la dieta y otros factores. La diversidad microbiana general y la presencia de bacterias con funciones beneficiosas suelen considerarse indicadores importantes de salud.

¿Cómo afecta la dieta a mi tipo de intestino?
La dieta es uno de los factores más influyentes en la composición del microbioma. Como se mencionó, los tipos Bacteroides y Prevotella a menudo se asocian con dietas ricas en alimentos de origen animal o vegetal, respectivamente. Cambios significativos en la dieta pueden, con el tiempo, influir en la dominancia de ciertos grupos bacterianos.

¿Qué significa si tengo el tipo 'Other'?
El tipo 'Other' (Otro) se caracteriza por no tener un grupo dominante claro y, a menudo, por una alta diversidad de especies. La alta diversidad se considera generalmente beneficiosa para la salud intestinal. Significa que tu microbioma es rico en una variedad de bacterias, lo cual puede ser una señal positiva.

¿Debería tomar probióticos basados en mi tipo de intestino?
La respuesta a los probióticos puede variar entre individuos y tipos de intestino. Si bien algunos estudios sugieren respuestas diferenciadas, la ciencia aún está determinando las recomendaciones precisas basadas en el tipo. Una visión más integral de tu microbioma, incluyendo especies específicas, podría ser más útil para guiar el uso de suplementos.

Conclusión

La conexión entre el intestino y el cerebro es una vía compleja y fascinante que influye en nuestra salud integral. El microbioma intestinal, con sus diversas comunidades bacterianas, juega un papel clave en esta interacción. Si bien la clasificación del microbioma en tipos de intestino (enterotipos) ofrece una forma útil de agrupar y estudiar estas comunidades, es una simplificación de una realidad mucho más matizada. La investigación continua nos ayuda a comprender mejor cómo la composición y función de nuestro microbioma afecta nuestra salud física y mental, abriendo nuevas vías para el bienestar a través del cuidado de nuestro mundo interior microbiano.

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Jesús Porta Etessam

Soy licenciado en Medicina y Cirugía y Doctor en Neurociencias por la Universidad Complutense de Madrid. Me formé como especialista en Neurología realizando la residencia en el Hospital 12 de Octubre bajo la dirección de Alberto Portera y Alfonso Vallejo, donde también ejercí como adjunto durante seis años y fui tutor de residentes. Durante mi formación, realicé una rotación electiva en el Memorial Sloan Kettering Cancer Center.Posteriormente, fui Jefe de Sección en el Hospital Clínico San Carlos de Madrid y actualmente soy jefe de servicio de Neurología en el Hospital Universitario Fundación Jiménez Díaz. Tengo el honor de ser presidente de la Sociedad Española de Neurología, además de haber ocupado la vicepresidencia del Consejo Español del Cerebro y de ser Fellow de la European Academy of Neurology.A lo largo de mi trayectoria, he formado parte de la junta directiva de la Sociedad Española de Neurología como vocal de comunicación, relaciones internacionales, director de cultura y vicepresidente de relaciones institucionales. También dirigí la Fundación del Cerebro.Impulsé la creación del grupo de neurooftalmología de la SEN y he formado parte de las juntas de los grupos de cefalea y neurooftalmología. Además, he sido profesor de Neurología en la Universidad Complutense de Madrid durante más de 16 años.

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